Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD3

MRPL4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL4Q9BYD3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MRPL4Q9BYD3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms