Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY5

CAPS2, Calcyphosin-2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPS2Q9BXY5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPS2Q9BXY5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms