Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RSPO3Q9BXY4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms