Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX67

JAM3, Junctional adhesion molecule C, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAM3Q9BX67 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
JAM3Q9BX67 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms