Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWS9

CHID1, Chitinase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHID1Q9BWS9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms