Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWL3

C1orf43, Uncharacterized protein C1orf43, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf43Q9BWL3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf43Q9BWL3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf43Q9BWL3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf43Q9BWL3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf43Q9BWL3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf43Q9BWL3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf43Q9BWL3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf43Q9BWL3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf43Q9BWL3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf43Q9BWL3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf43Q9BWL3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf43Q9BWL3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf43Q9BWL3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf43Q9BWL3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf43Q9BWL3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf43Q9BWL3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf43Q9BWL3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf43Q9BWL3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf43Q9BWL3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf43Q9BWL3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf43Q9BWL3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf43Q9BWL3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf43Q9BWL3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf43Q9BWL3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf43Q9BWL3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf43Q9BWL3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf43Q9BWL3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf43Q9BWL3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf43Q9BWL3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf43Q9BWL3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf43Q9BWL3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf43Q9BWL3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf43Q9BWL3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf43Q9BWL3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf43Q9BWL3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms