Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUE0

MED18, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 18, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED18Q9BUE0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED18Q9BUE0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
MED18Q9BUE0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED18Q9BUE0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED18Q9BUE0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED18Q9BUE0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED18Q9BUE0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED18Q9BUE0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED18Q9BUE0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED18Q9BUE0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED18Q9BUE0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED18Q9BUE0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED18Q9BUE0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED18Q9BUE0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED18Q9BUE0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED18Q9BUE0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MED18Q9BUE0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MED18Q9BUE0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MED18Q9BUE0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MED18Q9BUE0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MED18Q9BUE0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MED18Q9BUE0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MED18Q9BUE0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MED18Q9BUE0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MED18Q9BUE0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MED18Q9BUE0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms