Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms