Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms