Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SDF4Q9BRK5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SDF4Q9BRK5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SDF4Q9BRK5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SDF4Q9BRK5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SDF4Q9BRK5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SDF4Q9BRK5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SDF4Q9BRK5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SDF4Q9BRK5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SDF4Q9BRK5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SDF4Q9BRK5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SDF4Q9BRK5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SDF4Q9BRK5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SDF4Q9BRK5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SDF4Q9BRK5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SDF4Q9BRK5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SDF4Q9BRK5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SDF4Q9BRK5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SDF4Q9BRK5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SDF4Q9BRK5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SDF4Q9BRK5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SDF4Q9BRK5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SDF4Q9BRK5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SDF4Q9BRK5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SDF4Q9BRK5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SDF4Q9BRK5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SDF4Q9BRK5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SDF4Q9BRK5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SDF4Q9BRK5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SDF4Q9BRK5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SDF4Q9BRK5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SDF4Q9BRK5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SDF4Q9BRK5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SDF4Q9BRK5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SDF4Q9BRK5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SDF4Q9BRK5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SDF4Q9BRK5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SDF4Q9BRK5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SDF4Q9BRK5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SDF4Q9BRK5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SDF4Q9BRK5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SDF4Q9BRK5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SDF4Q9BRK5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SDF4Q9BRK5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SDF4Q9BRK5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SDF4Q9BRK5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SDF4Q9BRK5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SDF4Q9BRK5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SDF4Q9BRK5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SDF4Q9BRK5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SDF4Q9BRK5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SDF4Q9BRK5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SDF4Q9BRK5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SDF4Q9BRK5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SDF4Q9BRK5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SDF4Q9BRK5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SDF4Q9BRK5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SDF4Q9BRK5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SDF4Q9BRK5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SDF4Q9BRK5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SDF4Q9BRK5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SDF4Q9BRK5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SDF4Q9BRK5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SDF4Q9BRK5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SDF4Q9BRK5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SDF4Q9BRK5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SDF4Q9BRK5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SDF4Q9BRK5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SDF4Q9BRK5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SDF4Q9BRK5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SDF4Q9BRK5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SDF4Q9BRK5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SDF4Q9BRK5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SDF4Q9BRK5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SDF4Q9BRK5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SDF4Q9BRK5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SDF4Q9BRK5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SDF4Q9BRK5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SDF4Q9BRK5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SDF4Q9BRK5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SDF4Q9BRK5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SDF4Q9BRK5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SDF4Q9BRK5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SDF4Q9BRK5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SDF4Q9BRK5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SDF4Q9BRK5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SDF4Q9BRK5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms