Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ83

SLX1A, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX1AQ9BQ83 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLX1AQ9BQ83 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLX1AQ9BQ83 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLX1AQ9BQ83 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLX1AQ9BQ83 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLX1AQ9BQ83 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLX1AQ9BQ83 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLX1AQ9BQ83 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLX1AQ9BQ83 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLX1AQ9BQ83 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLX1AQ9BQ83 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLX1AQ9BQ83 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLX1AQ9BQ83 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLX1AQ9BQ83 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLX1AQ9BQ83 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLX1AQ9BQ83 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLX1AQ9BQ83 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLX1AQ9BQ83 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLX1AQ9BQ83 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLX1AQ9BQ83 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLX1AQ9BQ83 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLX1AQ9BQ83 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLX1AQ9BQ83 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLX1AQ9BQ83 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLX1AQ9BQ83 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLX1AQ9BQ83 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLX1AQ9BQ83 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLX1AQ9BQ83 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLX1AQ9BQ83 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLX1AQ9BQ83 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLX1AQ9BQ83 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLX1AQ9BQ83 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLX1AQ9BQ83 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLX1AQ9BQ83 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLX1AQ9BQ83 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLX1AQ9BQ83 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms