Protein–RNA interactions for Protein: Q99829

CPNE1, Copine-1, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE1Q99829 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPNE1Q99829 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CPNE1Q99829 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPNE1Q99829 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPNE1Q99829 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPNE1Q99829 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPNE1Q99829 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPNE1Q99829 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPNE1Q99829 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPNE1Q99829 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPNE1Q99829 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPNE1Q99829 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPNE1Q99829 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPNE1Q99829 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CPNE1Q99829 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPNE1Q99829 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPNE1Q99829 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPNE1Q99829 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPNE1Q99829 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPNE1Q99829 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPNE1Q99829 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPNE1Q99829 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CPNE1Q99829 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPNE1Q99829 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPNE1Q99829 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPNE1Q99829 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPNE1Q99829 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPNE1Q99829 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPNE1Q99829 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CPNE1Q99829 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPNE1Q99829 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPNE1Q99829 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPNE1Q99829 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPNE1Q99829 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPNE1Q99829 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPNE1Q99829 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPNE1Q99829 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPNE1Q99829 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPNE1Q99829 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPNE1Q99829 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPNE1Q99829 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPNE1Q99829 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPNE1Q99829 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPNE1Q99829 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPNE1Q99829 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPNE1Q99829 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPNE1Q99829 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms