Protein–RNA interactions for Protein: Q99720

SIGMAR1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1Q99720 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIGMAR1Q99720 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms