Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LGMNQ99538 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms