Protein–RNA interactions for Protein: Q96S86

HAPLN3, Hyaluronan and proteoglycan link protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN3Q96S86 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HAPLN3Q96S86 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms