Protein–RNA interactions for Protein: Q96S66

CLCC1, Chloride channel CLIC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCC1Q96S66 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLCC1Q96S66 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CLCC1Q96S66 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CLCC1Q96S66 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CLCC1Q96S66 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLCC1Q96S66 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLCC1Q96S66 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLCC1Q96S66 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLCC1Q96S66 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLCC1Q96S66 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLCC1Q96S66 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLCC1Q96S66 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLCC1Q96S66 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLCC1Q96S66 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLCC1Q96S66 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CLCC1Q96S66 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLCC1Q96S66 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLCC1Q96S66 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CLCC1Q96S66 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLCC1Q96S66 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLCC1Q96S66 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CLCC1Q96S66 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLCC1Q96S66 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CLCC1Q96S66 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLCC1Q96S66 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLCC1Q96S66 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CLCC1Q96S66 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLCC1Q96S66 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLCC1Q96S66 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CLCC1Q96S66 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLCC1Q96S66 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CLCC1Q96S66 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLCC1Q96S66 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLCC1Q96S66 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLCC1Q96S66 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLCC1Q96S66 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLCC1Q96S66 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLCC1Q96S66 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLCC1Q96S66 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CLCC1Q96S66 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLCC1Q96S66 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms