Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3IPQ96QF0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms