Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKRD27Q96NW4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKRD27Q96NW4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKRD27Q96NW4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKRD27Q96NW4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKRD27Q96NW4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKRD27Q96NW4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKRD27Q96NW4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKRD27Q96NW4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKRD27Q96NW4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKRD27Q96NW4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKRD27Q96NW4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD27Q96NW4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD27Q96NW4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD27Q96NW4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD27Q96NW4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD27Q96NW4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD27Q96NW4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD27Q96NW4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD27Q96NW4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD27Q96NW4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD27Q96NW4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKRD27Q96NW4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKRD27Q96NW4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKRD27Q96NW4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKRD27Q96NW4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKRD27Q96NW4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKRD27Q96NW4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKRD27Q96NW4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKRD27Q96NW4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ANKRD27Q96NW4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms