Protein–RNA interactions for Protein: Q96MS0

ROBO3, Roundabout homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO3Q96MS0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ROBO3Q96MS0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ROBO3Q96MS0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ROBO3Q96MS0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ROBO3Q96MS0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ROBO3Q96MS0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ROBO3Q96MS0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ROBO3Q96MS0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ROBO3Q96MS0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ROBO3Q96MS0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ROBO3Q96MS0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ROBO3Q96MS0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ROBO3Q96MS0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ROBO3Q96MS0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ROBO3Q96MS0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ROBO3Q96MS0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ROBO3Q96MS0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ROBO3Q96MS0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ROBO3Q96MS0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ROBO3Q96MS0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ROBO3Q96MS0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ROBO3Q96MS0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ROBO3Q96MS0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ROBO3Q96MS0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ROBO3Q96MS0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ROBO3Q96MS0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ROBO3Q96MS0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ROBO3Q96MS0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ROBO3Q96MS0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ROBO3Q96MS0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ROBO3Q96MS0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ROBO3Q96MS0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ROBO3Q96MS0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ROBO3Q96MS0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ROBO3Q96MS0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ROBO3Q96MS0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ROBO3Q96MS0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ROBO3Q96MS0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ROBO3Q96MS0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ROBO3Q96MS0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ROBO3Q96MS0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ROBO3Q96MS0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ROBO3Q96MS0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ROBO3Q96MS0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ROBO3Q96MS0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ROBO3Q96MS0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ROBO3Q96MS0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ROBO3Q96MS0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ROBO3Q96MS0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ROBO3Q96MS0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ROBO3Q96MS0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ROBO3Q96MS0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ROBO3Q96MS0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ROBO3Q96MS0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ROBO3Q96MS0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ROBO3Q96MS0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ROBO3Q96MS0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ROBO3Q96MS0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ROBO3Q96MS0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ROBO3Q96MS0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ROBO3Q96MS0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ROBO3Q96MS0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ROBO3Q96MS0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ROBO3Q96MS0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ROBO3Q96MS0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ROBO3Q96MS0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ROBO3Q96MS0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ROBO3Q96MS0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
ROBO3Q96MS0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ROBO3Q96MS0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ROBO3Q96MS0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ROBO3Q96MS0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ROBO3Q96MS0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ROBO3Q96MS0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ROBO3Q96MS0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ROBO3Q96MS0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ROBO3Q96MS0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ROBO3Q96MS0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ROBO3Q96MS0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ROBO3Q96MS0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ROBO3Q96MS0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ROBO3Q96MS0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ROBO3Q96MS0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ROBO3Q96MS0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ROBO3Q96MS0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ROBO3Q96MS0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ROBO3Q96MS0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ROBO3Q96MS0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ROBO3Q96MS0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ROBO3Q96MS0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ROBO3Q96MS0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ROBO3Q96MS0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ROBO3Q96MS0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ROBO3Q96MS0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ROBO3Q96MS0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ROBO3Q96MS0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ROBO3Q96MS0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ROBO3Q96MS0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ROBO3Q96MS0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ROBO3Q96MS0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms