Protein–RNA interactions for Protein: Q96H20

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNF8Q96H20 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNF8Q96H20 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms