Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCARF2Q96GP6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCARF2Q96GP6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCARF2Q96GP6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCARF2Q96GP6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCARF2Q96GP6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCARF2Q96GP6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCARF2Q96GP6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCARF2Q96GP6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCARF2Q96GP6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCARF2Q96GP6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCARF2Q96GP6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCARF2Q96GP6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCARF2Q96GP6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCARF2Q96GP6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCARF2Q96GP6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCARF2Q96GP6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCARF2Q96GP6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARF2Q96GP6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARF2Q96GP6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARF2Q96GP6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARF2Q96GP6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARF2Q96GP6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARF2Q96GP6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARF2Q96GP6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARF2Q96GP6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARF2Q96GP6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARF2Q96GP6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARF2Q96GP6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARF2Q96GP6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARF2Q96GP6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARF2Q96GP6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARF2Q96GP6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SCARF2Q96GP6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCARF2Q96GP6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCARF2Q96GP6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SCARF2Q96GP6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCARF2Q96GP6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCARF2Q96GP6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCARF2Q96GP6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCARF2Q96GP6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCARF2Q96GP6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCARF2Q96GP6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCARF2Q96GP6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCARF2Q96GP6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCARF2Q96GP6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCARF2Q96GP6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCARF2Q96GP6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCARF2Q96GP6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCARF2Q96GP6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms