Protein–RNA interactions for Protein: Q96EQ0

SGTB, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein beta, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTBQ96EQ0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGTBQ96EQ0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGTBQ96EQ0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGTBQ96EQ0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SGTBQ96EQ0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGTBQ96EQ0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGTBQ96EQ0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGTBQ96EQ0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGTBQ96EQ0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGTBQ96EQ0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGTBQ96EQ0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGTBQ96EQ0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGTBQ96EQ0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGTBQ96EQ0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SGTBQ96EQ0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms