Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
MTERF3Q96E29 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MTERF3Q96E29 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms