Protein–RNA interactions for Protein: Q96C74

ROPN1L, Ropporin-1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1LQ96C74 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ROPN1LQ96C74 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ROPN1LQ96C74 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ROPN1LQ96C74 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ROPN1LQ96C74 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ROPN1LQ96C74 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ROPN1LQ96C74 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ROPN1LQ96C74 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ROPN1LQ96C74 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ROPN1LQ96C74 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ROPN1LQ96C74 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ROPN1LQ96C74 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ROPN1LQ96C74 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ROPN1LQ96C74 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ROPN1LQ96C74 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ROPN1LQ96C74 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ROPN1LQ96C74 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ROPN1LQ96C74 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ROPN1LQ96C74 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ROPN1LQ96C74 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ROPN1LQ96C74 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ROPN1LQ96C74 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ROPN1LQ96C74 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ROPN1LQ96C74 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ROPN1LQ96C74 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ROPN1LQ96C74 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
ROPN1LQ96C74 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ROPN1LQ96C74 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ROPN1LQ96C74 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms