Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EFHD2Q96C19 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms