Protein–RNA interactions for Protein: Q96AN5

TMEM143, Transmembrane protein 143, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM143Q96AN5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM143Q96AN5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM143Q96AN5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM143Q96AN5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM143Q96AN5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM143Q96AN5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM143Q96AN5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM143Q96AN5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM143Q96AN5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM143Q96AN5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM143Q96AN5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM143Q96AN5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM143Q96AN5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM143Q96AN5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM143Q96AN5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM143Q96AN5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM143Q96AN5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM143Q96AN5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM143Q96AN5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM143Q96AN5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM143Q96AN5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM143Q96AN5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM143Q96AN5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM143Q96AN5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM143Q96AN5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM143Q96AN5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM143Q96AN5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM143Q96AN5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM143Q96AN5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM143Q96AN5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM143Q96AN5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM143Q96AN5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM143Q96AN5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM143Q96AN5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM143Q96AN5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM143Q96AN5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM143Q96AN5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM143Q96AN5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM143Q96AN5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM143Q96AN5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM143Q96AN5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM143Q96AN5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM143Q96AN5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM143Q96AN5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM143Q96AN5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM143Q96AN5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms