Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN3Q969G5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN3Q969G5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN3Q969G5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN3Q969G5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN3Q969G5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN3Q969G5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN3Q969G5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN3Q969G5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN3Q969G5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAVIN3Q969G5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAVIN3Q969G5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAVIN3Q969G5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAVIN3Q969G5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAVIN3Q969G5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN3Q969G5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN3Q969G5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN3Q969G5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN3Q969G5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN3Q969G5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN3Q969G5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN3Q969G5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAVIN3Q969G5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAVIN3Q969G5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAVIN3Q969G5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAVIN3Q969G5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAVIN3Q969G5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAVIN3Q969G5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAVIN3Q969G5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAVIN3Q969G5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAVIN3Q969G5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAVIN3Q969G5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAVIN3Q969G5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAVIN3Q969G5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAVIN3Q969G5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAVIN3Q969G5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAVIN3Q969G5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAVIN3Q969G5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CAVIN3Q969G5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAVIN3Q969G5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms