Protein–RNA interactions for Protein: Q969G2

LHX4, LIM/homeobox protein Lhx4, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX4Q969G2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LHX4Q969G2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148 ms