Protein–RNA interactions for Protein: Q969D9

TSLP, Thymic stromal lymphopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSLPQ969D9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSLPQ969D9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSLPQ969D9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSLPQ969D9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSLPQ969D9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSLPQ969D9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TSLPQ969D9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSLPQ969D9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSLPQ969D9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSLPQ969D9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSLPQ969D9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSLPQ969D9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSLPQ969D9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSLPQ969D9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TSLPQ969D9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSLPQ969D9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSLPQ969D9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TSLPQ969D9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TSLPQ969D9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSLPQ969D9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSLPQ969D9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSLPQ969D9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSLPQ969D9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSLPQ969D9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSLPQ969D9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSLPQ969D9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSLPQ969D9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSLPQ969D9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSLPQ969D9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSLPQ969D9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSLPQ969D9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSLPQ969D9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TSLPQ969D9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSLPQ969D9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSLPQ969D9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSLPQ969D9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSLPQ969D9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms