Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms