Protein–RNA interactions for Protein: Q92932

PTPRN2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2Q92932 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRN2Q92932 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRN2Q92932 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRN2Q92932 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRN2Q92932 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRN2Q92932 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRN2Q92932 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRN2Q92932 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRN2Q92932 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRN2Q92932 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRN2Q92932 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRN2Q92932 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRN2Q92932 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRN2Q92932 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRN2Q92932 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRN2Q92932 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRN2Q92932 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRN2Q92932 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRN2Q92932 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRN2Q92932 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRN2Q92932 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRN2Q92932 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRN2Q92932 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRN2Q92932 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRN2Q92932 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRN2Q92932 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRN2Q92932 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRN2Q92932 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRN2Q92932 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRN2Q92932 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRN2Q92932 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRN2Q92932 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRN2Q92932 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRN2Q92932 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRN2Q92932 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRN2Q92932 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRN2Q92932 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRN2Q92932 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRN2Q92932 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRN2Q92932 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRN2Q92932 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRN2Q92932 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRN2Q92932 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRN2Q92932 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms