Protein–RNA interactions for Protein: Q92786

PROX1, Prospero homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX1Q92786 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PROX1Q92786 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PROX1Q92786 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PROX1Q92786 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PROX1Q92786 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PROX1Q92786 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PROX1Q92786 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PROX1Q92786 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PROX1Q92786 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PROX1Q92786 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PROX1Q92786 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PROX1Q92786 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PROX1Q92786 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PROX1Q92786 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PROX1Q92786 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PROX1Q92786 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PROX1Q92786 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PROX1Q92786 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PROX1Q92786 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PROX1Q92786 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PROX1Q92786 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PROX1Q92786 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PROX1Q92786 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PROX1Q92786 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PROX1Q92786 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PROX1Q92786 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PROX1Q92786 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PROX1Q92786 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PROX1Q92786 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PROX1Q92786 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PROX1Q92786 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PROX1Q92786 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PROX1Q92786 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PROX1Q92786 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PROX1Q92786 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PROX1Q92786 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PROX1Q92786 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PROX1Q92786 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PROX1Q92786 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PROX1Q92786 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PROX1Q92786 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PROX1Q92786 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PROX1Q92786 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PROX1Q92786 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PROX1Q92786 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PROX1Q92786 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PROX1Q92786 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PROX1Q92786 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PROX1Q92786 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PROX1Q92786 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PROX1Q92786 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PROX1Q92786 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PROX1Q92786 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PROX1Q92786 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PROX1Q92786 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PROX1Q92786 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PROX1Q92786 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PROX1Q92786 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PROX1Q92786 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PROX1Q92786 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PROX1Q92786 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PROX1Q92786 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PROX1Q92786 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PROX1Q92786 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PROX1Q92786 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PROX1Q92786 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PROX1Q92786 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PROX1Q92786 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms