Protein–RNA interactions for Protein: Q92543

SNX19, Sorting nexin-19, humanhuman

Predictions only

Length 992 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX19Q92543 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX19Q92543 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNX19Q92543 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNX19Q92543 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX19Q92543 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX19Q92543 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX19Q92543 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX19Q92543 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX19Q92543 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX19Q92543 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX19Q92543 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX19Q92543 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX19Q92543 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX19Q92543 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX19Q92543 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX19Q92543 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX19Q92543 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX19Q92543 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX19Q92543 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX19Q92543 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX19Q92543 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX19Q92543 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX19Q92543 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX19Q92543 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX19Q92543 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX19Q92543 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX19Q92543 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX19Q92543 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX19Q92543 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX19Q92543 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX19Q92543 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX19Q92543 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX19Q92543 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX19Q92543 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX19Q92543 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX19Q92543 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX19Q92543 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX19Q92543 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX19Q92543 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX19Q92543 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX19Q92543 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX19Q92543 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX19Q92543 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX19Q92543 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX19Q92543 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX19Q92543 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX19Q92543 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX19Q92543 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX19Q92543 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX19Q92543 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX19Q92543 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX19Q92543 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX19Q92543 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SNX19Q92543 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX19Q92543 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX19Q92543 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX19Q92543 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX19Q92543 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX19Q92543 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX19Q92543 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX19Q92543 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX19Q92543 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX19Q92543 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX19Q92543 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX19Q92543 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX19Q92543 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX19Q92543 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX19Q92543 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX19Q92543 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX19Q92543 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX19Q92543 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX19Q92543 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX19Q92543 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX19Q92543 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX19Q92543 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX19Q92543 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX19Q92543 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX19Q92543 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX19Q92543 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms