Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN0

ATG4A, Cysteine protease ATG4A, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AQ8WYN0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG4AQ8WYN0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG4AQ8WYN0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG4AQ8WYN0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG4AQ8WYN0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG4AQ8WYN0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG4AQ8WYN0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG4AQ8WYN0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG4AQ8WYN0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG4AQ8WYN0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG4AQ8WYN0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG4AQ8WYN0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG4AQ8WYN0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG4AQ8WYN0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG4AQ8WYN0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG4AQ8WYN0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG4AQ8WYN0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG4AQ8WYN0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG4AQ8WYN0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG4AQ8WYN0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG4AQ8WYN0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG4AQ8WYN0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG4AQ8WYN0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG4AQ8WYN0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG4AQ8WYN0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG4AQ8WYN0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATG4AQ8WYN0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATG4AQ8WYN0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATG4AQ8WYN0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATG4AQ8WYN0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ATG4AQ8WYN0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms