Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA9

SREK1, Splicing regulatory glutamine/lysine-rich protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREK1Q8WXA9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SREK1Q8WXA9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms