Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX39

LCN9, Epididymal-specific lipocalin-9, humanhuman

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN9Q8WX39 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCN9Q8WX39 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCN9Q8WX39 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LCN9Q8WX39 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCN9Q8WX39 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCN9Q8WX39 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCN9Q8WX39 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
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LCN9Q8WX39 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
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LCN9Q8WX39 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCN9Q8WX39 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCN9Q8WX39 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCN9Q8WX39 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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LCN9Q8WX39 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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LCN9Q8WX39 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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LCN9Q8WX39 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCN9Q8WX39 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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LCN9Q8WX39 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCN9Q8WX39 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCN9Q8WX39 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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LCN9Q8WX39 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
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LCN9Q8WX39 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCN9Q8WX39 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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LCN9Q8WX39 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCN9Q8WX39 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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LCN9Q8WX39 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
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LCN9Q8WX39 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
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LCN9Q8WX39 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCN9Q8WX39 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
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LCN9Q8WX39 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCN9Q8WX39 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCN9Q8WX39 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCN9Q8WX39 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCN9Q8WX39 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LCN9Q8WX39 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCN9Q8WX39 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCN9Q8WX39 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LCN9Q8WX39 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCN9Q8WX39 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCN9Q8WX39 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCN9Q8WX39 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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