Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM8

SCFD1, Sec1 family domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCFD1Q8WVM8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCFD1Q8WVM8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCFD1Q8WVM8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms