Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVK2

SNRNP27, U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein 27 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP27Q8WVK2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRNP27Q8WVK2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRNP27Q8WVK2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRNP27Q8WVK2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRNP27Q8WVK2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRNP27Q8WVK2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRNP27Q8WVK2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRNP27Q8WVK2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRNP27Q8WVK2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRNP27Q8WVK2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRNP27Q8WVK2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRNP27Q8WVK2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRNP27Q8WVK2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRNP27Q8WVK2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRNP27Q8WVK2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRNP27Q8WVK2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRNP27Q8WVK2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRNP27Q8WVK2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRNP27Q8WVK2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRNP27Q8WVK2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRNP27Q8WVK2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRNP27Q8WVK2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRNP27Q8WVK2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRNP27Q8WVK2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRNP27Q8WVK2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRNP27Q8WVK2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRNP27Q8WVK2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRNP27Q8WVK2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRNP27Q8WVK2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNRNP27Q8WVK2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNRNP27Q8WVK2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms