Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRN4Q8WUT4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRN4Q8WUT4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRN4Q8WUT4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRN4Q8WUT4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRN4Q8WUT4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRN4Q8WUT4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRN4Q8WUT4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRN4Q8WUT4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRN4Q8WUT4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRN4Q8WUT4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRN4Q8WUT4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRN4Q8WUT4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRN4Q8WUT4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRN4Q8WUT4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRN4Q8WUT4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRN4Q8WUT4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRN4Q8WUT4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRN4Q8WUT4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRN4Q8WUT4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRN4Q8WUT4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRN4Q8WUT4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRN4Q8WUT4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRN4Q8WUT4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRN4Q8WUT4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRN4Q8WUT4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRN4Q8WUT4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRN4Q8WUT4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRN4Q8WUT4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRN4Q8WUT4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRN4Q8WUT4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRN4Q8WUT4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRN4Q8WUT4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRN4Q8WUT4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRN4Q8WUT4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRN4Q8WUT4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRN4Q8WUT4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRN4Q8WUT4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRN4Q8WUT4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRN4Q8WUT4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRN4Q8WUT4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRN4Q8WUT4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRN4Q8WUT4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRN4Q8WUT4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.2 ms