Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HDAC7Q8WUI4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC7Q8WUI4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms