Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY3

ACTRT2, Actin-related protein T2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT2Q8TDY3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTRT2Q8TDY3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ACTRT2Q8TDY3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
ACTRT2Q8TDY3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTRT2Q8TDY3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTRT2Q8TDY3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTRT2Q8TDY3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTRT2Q8TDY3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTRT2Q8TDY3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTRT2Q8TDY3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTRT2Q8TDY3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTRT2Q8TDY3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTRT2Q8TDY3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTRT2Q8TDY3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTRT2Q8TDY3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTRT2Q8TDY3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTRT2Q8TDY3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTRT2Q8TDY3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTRT2Q8TDY3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTRT2Q8TDY3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTRT2Q8TDY3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTRT2Q8TDY3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTRT2Q8TDY3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTRT2Q8TDY3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTRT2Q8TDY3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTRT2Q8TDY3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTRT2Q8TDY3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTRT2Q8TDY3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTRT2Q8TDY3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTRT2Q8TDY3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTRT2Q8TDY3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTRT2Q8TDY3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTRT2Q8TDY3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTRT2Q8TDY3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTRT2Q8TDY3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTRT2Q8TDY3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTRT2Q8TDY3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTRT2Q8TDY3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTRT2Q8TDY3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTRT2Q8TDY3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTRT2Q8TDY3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTRT2Q8TDY3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTRT2Q8TDY3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTRT2Q8TDY3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTRT2Q8TDY3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTRT2Q8TDY3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTRT2Q8TDY3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTRT2Q8TDY3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTRT2Q8TDY3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTRT2Q8TDY3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTRT2Q8TDY3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms