Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD30

GPT2, Alanine aminotransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPT2Q8TD30 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPT2Q8TD30 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GPT2Q8TD30 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GPT2Q8TD30 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GPT2Q8TD30 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GPT2Q8TD30 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GPT2Q8TD30 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GPT2Q8TD30 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GPT2Q8TD30 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GPT2Q8TD30 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GPT2Q8TD30 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPT2Q8TD30 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GPT2Q8TD30 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPT2Q8TD30 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPT2Q8TD30 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPT2Q8TD30 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPT2Q8TD30 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPT2Q8TD30 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPT2Q8TD30 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GPT2Q8TD30 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPT2Q8TD30 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPT2Q8TD30 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPT2Q8TD30 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPT2Q8TD30 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPT2Q8TD30 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPT2Q8TD30 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPT2Q8TD30 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPT2Q8TD30 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPT2Q8TD30 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPT2Q8TD30 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPT2Q8TD30 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPT2Q8TD30 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPT2Q8TD30 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPT2Q8TD30 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPT2Q8TD30 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms