Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF398Q8TD17 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF398Q8TD17 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF398Q8TD17 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF398Q8TD17 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF398Q8TD17 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF398Q8TD17 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF398Q8TD17 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF398Q8TD17 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF398Q8TD17 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF398Q8TD17 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF398Q8TD17 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF398Q8TD17 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF398Q8TD17 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF398Q8TD17 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF398Q8TD17 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF398Q8TD17 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF398Q8TD17 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF398Q8TD17 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF398Q8TD17 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF398Q8TD17 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF398Q8TD17 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF398Q8TD17 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF398Q8TD17 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF398Q8TD17 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF398Q8TD17 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF398Q8TD17 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF398Q8TD17 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF398Q8TD17 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF398Q8TD17 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF398Q8TD17 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF398Q8TD17 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF398Q8TD17 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF398Q8TD17 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF398Q8TD17 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF398Q8TD17 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF398Q8TD17 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF398Q8TD17 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF398Q8TD17 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF398Q8TD17 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF398Q8TD17 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF398Q8TD17 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF398Q8TD17 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF398Q8TD17 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF398Q8TD17 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF398Q8TD17 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF398Q8TD17 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF398Q8TD17 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF398Q8TD17 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF398Q8TD17 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms