Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG48

LINS1, Protein Lines homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINS1Q8NG48 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LINS1Q8NG48 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LINS1Q8NG48 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LINS1Q8NG48 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LINS1Q8NG48 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LINS1Q8NG48 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LINS1Q8NG48 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LINS1Q8NG48 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
LINS1Q8NG48 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LINS1Q8NG48 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LINS1Q8NG48 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LINS1Q8NG48 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LINS1Q8NG48 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LINS1Q8NG48 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LINS1Q8NG48 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LINS1Q8NG48 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LINS1Q8NG48 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LINS1Q8NG48 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LINS1Q8NG48 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LINS1Q8NG48 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LINS1Q8NG48 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LINS1Q8NG48 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LINS1Q8NG48 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LINS1Q8NG48 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LINS1Q8NG48 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LINS1Q8NG48 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LINS1Q8NG48 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LINS1Q8NG48 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LINS1Q8NG48 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LINS1Q8NG48 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LINS1Q8NG48 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LINS1Q8NG48 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LINS1Q8NG48 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LINS1Q8NG48 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LINS1Q8NG48 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LINS1Q8NG48 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LINS1Q8NG48 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LINS1Q8NG48 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LINS1Q8NG48 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LINS1Q8NG48 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LINS1Q8NG48 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LINS1Q8NG48 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LINS1Q8NG48 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LINS1Q8NG48 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LINS1Q8NG48 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LINS1Q8NG48 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LINS1Q8NG48 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LINS1Q8NG48 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LINS1Q8NG48 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LINS1Q8NG48 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LINS1Q8NG48 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LINS1Q8NG48 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LINS1Q8NG48 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LINS1Q8NG48 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LINS1Q8NG48 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LINS1Q8NG48 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LINS1Q8NG48 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LINS1Q8NG48 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LINS1Q8NG48 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
LINS1Q8NG48 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LINS1Q8NG48 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
LINS1Q8NG48 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LINS1Q8NG48 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LINS1Q8NG48 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LINS1Q8NG48 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LINS1Q8NG48 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LINS1Q8NG48 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LINS1Q8NG48 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LINS1Q8NG48 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LINS1Q8NG48 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LINS1Q8NG48 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LINS1Q8NG48 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LINS1Q8NG48 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LINS1Q8NG48 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LINS1Q8NG48 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LINS1Q8NG48 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LINS1Q8NG48 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LINS1Q8NG48 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LINS1Q8NG48 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LINS1Q8NG48 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LINS1Q8NG48 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LINS1Q8NG48 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LINS1Q8NG48 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LINS1Q8NG48 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LINS1Q8NG48 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LINS1Q8NG48 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LINS1Q8NG48 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LINS1Q8NG48 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
LINS1Q8NG48 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LINS1Q8NG48 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LINS1Q8NG48 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LINS1Q8NG48 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LINS1Q8NG48 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LINS1Q8NG48 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LINS1Q8NG48 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LINS1Q8NG48 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LINS1Q8NG48 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LINS1Q8NG48 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LINS1Q8NG48 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LINS1Q8NG48 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms