Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEC5

CATSPER1, Cation channel sperm-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER1Q8NEC5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CATSPER1Q8NEC5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms