Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM87AQ8NBN3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM87AQ8NBN3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM87AQ8NBN3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM87AQ8NBN3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM87AQ8NBN3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM87AQ8NBN3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM87AQ8NBN3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM87AQ8NBN3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM87AQ8NBN3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM87AQ8NBN3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM87AQ8NBN3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM87AQ8NBN3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM87AQ8NBN3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM87AQ8NBN3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM87AQ8NBN3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM87AQ8NBN3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM87AQ8NBN3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM87AQ8NBN3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM87AQ8NBN3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM87AQ8NBN3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM87AQ8NBN3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM87AQ8NBN3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM87AQ8NBN3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM87AQ8NBN3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM87AQ8NBN3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM87AQ8NBN3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM87AQ8NBN3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM87AQ8NBN3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM87AQ8NBN3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM87AQ8NBN3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TMEM87AQ8NBN3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TMEM87AQ8NBN3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM87AQ8NBN3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMEM87AQ8NBN3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
TMEM87AQ8NBN3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMEM87AQ8NBN3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM87AQ8NBN3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM87AQ8NBN3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM87AQ8NBN3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM87AQ8NBN3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM87AQ8NBN3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM87AQ8NBN3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM87AQ8NBN3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM87AQ8NBN3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM87AQ8NBN3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms