Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AVL9Q8NBF6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms