Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD42Q8N9B4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms