Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC155Q8N6L0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC155Q8N6L0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC155Q8N6L0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC155Q8N6L0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC155Q8N6L0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC155Q8N6L0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC155Q8N6L0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC155Q8N6L0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC155Q8N6L0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC155Q8N6L0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC155Q8N6L0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC155Q8N6L0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC155Q8N6L0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC155Q8N6L0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC155Q8N6L0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC155Q8N6L0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC155Q8N6L0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC155Q8N6L0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC155Q8N6L0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC155Q8N6L0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC155Q8N6L0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC155Q8N6L0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC155Q8N6L0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC155Q8N6L0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC155Q8N6L0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC155Q8N6L0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC155Q8N6L0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC155Q8N6L0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC155Q8N6L0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC155Q8N6L0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC155Q8N6L0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC155Q8N6L0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC155Q8N6L0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC155Q8N6L0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC155Q8N6L0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC155Q8N6L0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC155Q8N6L0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC155Q8N6L0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC155Q8N6L0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC155Q8N6L0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC155Q8N6L0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC155Q8N6L0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC155Q8N6L0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC155Q8N6L0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC155Q8N6L0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC155Q8N6L0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms