Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5U6

RNF10, RING finger protein 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF10Q8N5U6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF10Q8N5U6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF10Q8N5U6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF10Q8N5U6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF10Q8N5U6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF10Q8N5U6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF10Q8N5U6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF10Q8N5U6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF10Q8N5U6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF10Q8N5U6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF10Q8N5U6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF10Q8N5U6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF10Q8N5U6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF10Q8N5U6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF10Q8N5U6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF10Q8N5U6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF10Q8N5U6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF10Q8N5U6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF10Q8N5U6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF10Q8N5U6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF10Q8N5U6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF10Q8N5U6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF10Q8N5U6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF10Q8N5U6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF10Q8N5U6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF10Q8N5U6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF10Q8N5U6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF10Q8N5U6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RNF10Q8N5U6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF10Q8N5U6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms